DNAチップによる網羅的遺伝子発現解析サービスです。ヒト、マウス、ラット以外にも多くの種類の生物種での発現解析が可能です。
ポリメラーゼ連鎖反応（PCR） による増幅を経時的に測定することで、サンプルの定量を行なう解析サービスです。絶対定量、相対定量、比較Ct法の解析方法がありますのでサンプル数、遺伝子数などによって選択することも可能です。
ダイナミックアレイやデジタルアレイと呼ばれる独自のバイオチップを用いることに よって、サンプル間での組み合わせを効率的に測定し、ターゲットを探し当てます。サンプル数が多い場合には、プレート解析と比較すると解析日数やコストの面でも少なくて済むため経済的です。
ぜひじっくりご覧ください。
SNP（Single Nucleotide Polymorphism :一塩基多型)
ヒト染色体の30億の塩基対の内、99.9%は個人間で塩基配列は同じで、残り0.1%の塩基配列で個人間の差があります。この約1000塩基対に1つ程度の変異をSNPと呼びます。
遺伝的背景を調べたり、原因遺伝子が特定されている遺伝病について解析することが可能です。また、連鎖解析などを行うことで、疾患遺伝子を特定することも期待できます。
弊社では以下の項目でSNPsの同定が可能です。
⇒46サンプル単位での解析となります。（※サンプル数が少ない場合はお問い合わせください。）
ヒトSNPを網羅的に解析したい方にオススメです。
⇒数十ターゲット、数十サンプルでSNPを解析したい方にオススメです。
⇒数ターゲット、多サンプルでSNPを解析したい方にオススメです。
CNV(Copy Number Variation : コピー数多型)
ある集団のなかで1細胞あたりのコピー数が個人間で異なるゲノム領域のことを示します。
様々な疾患との関与が示唆されるコピー数多型（CNV）異常を検出することも新しい研究分野として注目されています。
弊社では以下の項目で解析が可能で す。
⇒サンプル中のターゲット核酸配列をカウントし、高精度でCNVの解析ができます。
⇒270万のコピー数のマーカーによって、ゲノム全体を対象にしているので網羅的な
CNVの発見、同定が可能です。
・Ovation® RNA Amplification System V2
血液サンプル、臨床サンプルなどから抽出したRNAサンプルに適しています。
増幅は3'末端より行います。（図1）
増幅にはTotal RNA量で5ng-100ngが必要です。
・Ovation® Pico RNA WTA System
超微量なサンプルや多少RNAの分解が進んだサンプルに適しています。
増幅は全域で行います。（図2）
増幅にはTotal RNA量で500pg-50ngが必要です。
・WT-Ovation™ FFPE RNA Amplification System
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE)組織サンプルや微量で分解が進んだサンプルに適しています。
増幅は全域で行います。（図2）
増幅にはTotal RNA量で50ng-100ngが必要です。
－蛍光標識試薬－
・Encore™ Biotin Module
増幅試薬使用後GeneChip®に進む際に使用します。
図1 図2
試薬の詳細についてはこちらをご覧下さい。
MediBic NuGEN製品ページ
ジェネティックラボグループ 株式会社GLab病理解析センター 先端医療開発部
〒060-0009 札幌市中央区北9条西15丁目28番地196 札幌ITフロントビル3F
TEL：011-644-7333 FAX：011-644-7611
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※厚生労働大臣が定める施設基準に適合しているものとして地方厚生局長等に届け出た保険医療機関において、細胞診によりベセスダ分類がＡＳＣ－ＵＳと判定された患者に対して行った場合に限り算定する。
※細胞診と同時に実施した場合は算定できない。
"ＨＰＶ核酸同定報告書"に、ハイリスク・ローリスクそれぞれについて定性判定（陰性or陽性）の結果を明記して報告いたします。
尚、ハイリスクグループとし「16,18,30,31,33,35,39,45,51,52,56,58,59,66型」、ローリスクグループとして「6,11型」を同定しています。
Epidemiologic classification of human papillomavirus types associated cervical cancer.
Munoz N, et al.
N Engl J Med. 348:518-527, 2003
これまでの研究手法では、癌組織中には癌細胞しか含まれないことを前提として解析するか、肉眼レベルで手術検体から癌組織と非癌部組織を分離して解析することしかできませんでした。このような解析精度の実験では、対象外の細胞由来の遺伝子が含まれるため解析結果にノイズが多く含まれるか、遺伝子発現のコントラストが低下することが予想されます。
ジェネティックラボのLCM回収サービスでは、形態学のエキスパートである病理専門医や臨床検査技師が組織・細胞像を確認しながら解析対象の細胞を単離できるた め、クオリティーの高い解析が実現できます。究極的には１細胞の遺伝子発現解析や変異解析、少数の癌細胞のコピー数解析やメチル化解析なども可能になりつつあります（標本作製方法により精度・感度は異なります）。
マウスの膵臓、腎臓からLCMを用いて特定の 細胞を単離・回収し、得られたRNAからTaqMan®プローブを用いたリアルタイムPCR法にて遺伝子発現解析を行いました。
適切な内部標準遺伝子で補正を行い、ΔΔCt法にて解析し、キャリブレーションサンプル（値を1とする）に対しての相対比を算出しました。
■凍結切片の組織像（膵臓）
RNA分解酵素が最も多い組織として知られている膵臓の凍結切片を作製し、クレシル紫染色を行いました。
■LCMによるランゲルハンス島の採取（膵臓）
LCMでランゲルハンス島およびランゲルハンス島以外の細胞を採取しました。
■ランゲルハンス島の遺伝子発現解析結果
LCMで 採取した細胞を用いてインスリン、グルカゴン、ソマトスタチンの遺伝子発現を解析しました。
以上より、LCMにより膵臓のラン ゲルハンス島に特異的な遺伝子発現解析を実現することができました。また、RNase活性が最も高い臓器である膵臓でこのような結果が得られたことにより、当社の技術が確かなものであり、ヒト臨床検体やマウスなどを用いた糖尿病研究に直ちに応用可能であることを示しています。
LCMで腎小体、腎小体を除いた皮質および髄質の細胞を採取しました。（図1-3）
■図1 腎小体
■図2 腎小体を除いた皮質
■図3 髄質
LCMで採取した細胞を用いてGAPDH，ACTB，Megalin，Nephrinの遺伝子発現を解析しました。（図4）
■図4 腎臓の遺伝子発現解析結果
以上より、LCMにより腎臓の部位特異的な遺伝子発現を確認することができました。
サンプルの状態に応じ、適切なキットを使い分け、RNAの抽出を行います。
・組織（肺、腎、肝、膵、腸、心、脳、筋組織、血管 など）
・培養細胞
・固定パラフィン包埋組織(FFPE : Formalin-Fixed Paraffin Embedded)
・血液
・その他 （様々なサンプルに対応可能ですので、ご相談下さい）
・濃度測定結果およびクオリティーチェック結果