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解析サービス

データマイニング

基礎データ解析

適応:Affymetrix® GeneChip®解析

弊社にてデータマイニングソフト「GeneSpring GX 11.0.0(Agilent Technologies社)」を使用して発現差による目的遺伝子の絞り込みなどの解析を行います。

Affymetrix® GeneChip®受託解析サービスをご依頼されたお客様には「(サンプル数)-1」の数の組み合わせ比較を無償で行っています。

詳細はお問い合わせください。

 

解析内容


①【全解析結果の表示】

解析された全遺伝子(プローブ)の結果を示します。(以下は参考画像です。)

 DataMining-All_Entities.jpg  DataMining-All_Entities_Scatter.jpg

Line Graph                   Scatter Plot

結果は、画像と各数値データをまとめたエクセル表でお返しいたします。

 


②【発現の低い下位20%のデータ削除】

 

全解析結果から、発現の低い(信頼性が低いと考えられる)下位20%のデータを削除します。

DataMining-Filtered_20-100.jpg  DataMining-Filtered_20-100_Scatter.jpg

Line Graph                   Scatter Plot

結果は、画像と各数値データをまとめたエクセル表でお返しいたします。

 


 

③【倍率変化(Fold Change) / 有意差検定による絞り込み】

 

ターゲット遺伝子等を倍率変化、もしくは有意差検定により絞り込み、その結果を報告いたします。

解析群が、1群3サンプル以上であれば、有意差検定が可能です。

  倍率変化(Fold Change)

DataMining-Fold_Change.jpg  DataMining-Fold_Change_Scatter.jpg

Line Graph                   Scatter Plot

   有意差検定(T-Test)

 DataMining-T_Test.jpg  DataMining-T_Test_Scatter.jpg

Line Graph                   Scatter Plot

 結果は、画像と各数値データをまとめたエクセル表でお返しいたします。

 

※上記画像は、全てAgilent Technologies社のデータマイニングソフト「GeneSpring」を使用して解析した画像です。許可無く転用、複製、改変などを禁じられています。

agilent.jpg


  【有償オプ ションサービス】

・詳細データ解析はこちらから


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ジェネティックラボグループ 株式会社ジェネティックラボ 先端医療開発部
〒060-0009 札幌市中央区北9条西15丁目28番地196 札幌ITフロントビル3F
TEL:011-644-7333 FAX:011-644-7611

 

 
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