株式会社ジェネティックラボ｜受託解析サービス - Exon Array - Gene Chip エクソンアレイ受託解析サービス

精度の高い遺伝子発現解析とエクソンレベルでの発現解析を実現
GeneChip(R) Human Exon Arrayは、新たなアレイデザイン戦略と超高密度のアレイ製造能力の組み合せにより、1枚のアレイによる、全ゲノムでのエクソンレベルの発現プロファイリングを可能とました。

GeneChip(R) Exon Array Systemは、新たな次元のヒトゲノム探索を研究者にもたらすものであり、たとえば、以下のことが可能になります。

個々のエクソンのグローバルな発現を調べ、新たな選択的スプラインシングを発見し、記録する。
ゲノムワイドなエクソンレベルの発現データと塩基配列情報とを組み合わせ、遺伝的変異により生じる表現型としてのスプライシングパターンを明らかにする。
マウスおよびラットの遺伝子地図上で対応する配列をHuman Exon 1.0 ST Arrayのデザインに組み入れることによって、より直接的な比較ゲノム学的情報を得る。
選択的スプライシングを数個の選ばれた遺伝子のみに焦点を絞って研究するという、他の手法がもつ限界を取り除き、1枚のアレイで全ゲノム的な展望を提供する。

この統合ソリューションの特長として、以下が挙げられます。

超高解像度の発現解析によって、ヒトゲノムの既知転写領域と予測される転写領域内にある100万以上のエクソンクラスターを照会
転写産物の全長にわたってセンスターゲットを生成するランダムプライミング法を採用した、独自のGeneChip(R) Whole Transcript（WT）Assayと試薬キット
ユーザー独自のさまざまなワークフローでデータを探索・解析する機会を提供する、柔軟性のあるデータ解析ソリューションと包括的なアノテーション

（1）お送り頂いたTotal RNAについて、NanoDrop（分光光度計）で濃度、純度を、Agilent 2100 Bioanalyzer（マイクロ流路電気泳動装置）を用いて分解度を測定します。: ※サンプル状態が弊社基準に満たない場合には、サンプルの再送をお願いする事がございます。; ※再送されたサンプルでの解析は、別途有料となります。
（2）rRNAを除去します。
（3）T7-(N)6 プライマーを用いてds cDNAを合成します。: さらにin vitro Transcriptionを行い、ｃRNAを得ます。
（4）cRNAをもとに、Random Primerを用いてcDNAを合成します。
（5）cDNAを断片化し、末端のラベル化を行います。
（6）GeneChip Exon Arrayにハイブリダイゼーション。
（7）Streptavidin-phycoerythrin、Biotinylated anti-streptavidin antibodyで染色。
（8）スキャニング。

生物種	使用Chip	内　容
Human	Human Exon 1.0 ST Array	約100万個のヒト遺伝子のエクソンに対するプローブを１枚のアレイに搭載。全ゲノムでのエクソン発現プロファイリングが可能です。
Mouse	Mouse Exon 1.0 ST Array	約100万個のマウス遺伝子のエクソンに対するプローブを１枚のアレイに搭載されています。
Rat	Rat Exon 1.0 ST Array	約85万個のラット遺伝子のエクソンに対するプローブを１枚にアレイに搭載しています。