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受託解析サービス


Mapping Array/網羅的SNPsジェノタイピング

【特長】

GeneChip(R) Mapping Arrayを利用して、スループットを向上させ、1データポイントあたりのコストを削減しながら、大規模な連鎖解析、アソシエーションスタディとコピー数研究を行うことができます。この高密度アレイには、数千の一塩基多型(SNP)が含まれています。アッセイは使いやすく、必要なプライマーも1つのみです。

Figure 1.2 GeneChip(R) Mapping Assay-XBA 1

AFFYMETRIX(R) Authorized service provider

【実験概要】

(1)お送り頂いたgenomicDNAについて、濃度、純度のチェックを行います。
※サンプル状態が弊社基準に満たない場合には、サンプルの再送をお願いする場合があります。
(2)ゲノムDNAを制限酵素処理により切断、アダプターを付加し、アダプター配列を認識するプライマーを用いてPCRを行います。
(3)得られたPCR産物をチェック後、フラグメント化します。
(4)末端ラベル反応にて、ビオチン化標識します。
(5)GeneChip Mapping Arrayにハイブリダイゼーションします。
(6)スキャニング。

【お送りいただくサンプル】

推奨のゲノムDNA抽出法

  • SDS/ProK消化、phenol-chloroform抽出、Microcon又は Centricon (Millipore)で精製、濃縮
  • QIAamp DNA Blood Maxi Kit (QIAGEN)にて抽出

【Chipの種類】

Chipの種類 内 容
Human Mapping
500Kセット
Human Mapping 250K Nsp Array NspとStyの2枚のアレイと1種類のプライマーで50万個以上のSNPのジェノタイピングが可能です。
Human Mapping 250K Sty Array
Human Mapping
100Kセット
Human Mapping 50K Xba Array XbaとHindの2枚のアレイと1種類のPCRプライマーで10万個以上のSNPのジェノタイピングが可能です。
Human Mapping 50K Hind Array
Human Mapping 10K 2.0 Xba Array 従来の10K Arrayを高密度化したアレイです。新たに19番染色体とX染色体のSNPを追加されています。

【サンプルの濃度と純度】

サンプル量:ゲノムDNA 1ug以上

50ng/uL以上(これ以下の場合はエタノール沈殿による濃縮作業が必要です)

A260/A280=1.8〜2.0


【ご注文時の注意事項】


【お申込書のダウンロード】

※ダウンロードしたファイルをプリントアウトし、必要事項をご記入のうえ、ご署名、捺印後、原本を送付してください。


【お見積もり依頼・お問い合わせ】

株式会社ジェネティックラボ 先端医療開発部
〒060-0009 札幌市中央区北9条西15丁目28番地196 札幌ITフロントビル3F
TEL:011-644-7333 FAX:011-644-7611
E-mail:adv-support@gene-lab.com


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