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解析サービス

核酸抽出

様々な組織、性状のサンプルから、核酸の抽出を行います。

RNA抽出 / RNA抽出(small RNAを含む)

DNA抽出

濃度測定とクオリティーチェック

 

 

 
お問い合わせ

【RNA抽出 / RNA抽出(small RNAを含む)】

 サンプルの状態に応じ、適切なキットを使い分け、RNAの抽出を行います。

  • サンプル性状

          ・組織(肺、腎、肝、膵、腸、心、脳、筋組織、血管 など)

          ・培養細胞

          ・固定パラフィン包埋組織(FFPE : Formalin-Fixed Paraffin Embedded)

          ・血液

          ・その他 (様々なサンプルに対応可能ですので、ご相談下さい)

  • 納品データ

 ・濃度測定結果およびクオリティーチェック結果 

 

FFPEサンプルからの核酸抽出


実臨床ではホルマリン固定した組織 をパラフィン包埋し、切片を作製し(薄切と言います)、染色し病理標本となった切片を病理専門医が鏡顕することにより診断を行っています。

こ のホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE : Formalin-Fixed Paraffin Embedded)サンプルは、病院の臨床診断に伴い作製、診断に使用され、病理検査室に保管されています。これらのFFPEサンプルには病理診断所見、予後などの臨床データが付随しており、核酸やタンパク質など分子レベルでの解析を可能にするアーカイブとしての活用が期待されています。

近年では、これらのFFPEサンプルの遺伝子発現や遺伝変異、DNAメチル化、タンパク質の発現や局在、修飾などの情報を解析し、診断のみならず創薬や治療 のバイオマーカー探索ツールとして活用することが可能になりつつあります。

ホルマリン固定パラフィン包埋組織のRNAの解析は一般的に困難であると言われています。理由としましては下記の点が考えられます。

  • 手術摘出臓器・組織などの臨床検体の場合、術後にホルマリン に浸漬するまでの時間が長く内在性のRNaseにより分解される
  • 長時間のホルマリン固定により核酸が分解される
  • ホルマリン固定 (共有結合固定) により、 核酸が他の成分と結合することによる核酸回収率の低下する
  • パラフィン包埋からスライド薄切までの複雑で長い工程やその温度変化により、RNAが劣化する


弊社では、これまでにFFPEサンプルの遺伝子発現解析を行ってきており、探索的な研究目的としては研究資源として活用できることを確認しております。ただし、中にはどうしても解析が困難なサンプルが含まれることは否定できません。そこで独自の方法によるクオリティチェック項目を設定し、RNA抽出後に解析へ進むことが可能かどうかの判断をサポートさせていただきます。また、その後の解析目的に応じた技術的なご提案も可能です。詳しくはお問い合わせくださ い。

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【DNA抽出】
サンプルの状態に応じ、適切なキットを使い分け、DNAの抽出を行います。
  • サンプル性状

          ・組織(肺、腎、肝、膵、腸、心、脳、筋組織、血管 など)

          ・微量組織(生検サンプル、皮膚など)

          ・培養細胞

          ・固定パラフィン包埋組織(FFPE : Formalin-Fixed Paraffin Embedded)

          ・血液

          ・羊水

          ・その他 (様々なサンプルに対応可能ですので、ご相談下さい)

  • 納品データ

          ・濃度測定結果

 

【濃度測定とクオリティーチェック】

・濃度測定

[適応] RNA, DNA

分光光度計NanoDrop(ND-1000)を使用し、濃度の測定を行います。

・クオリティーチェック

[適応] RNA

Agilent Technologies社Bioanalyzer2100を使用し、RNAの分解度を測定します。

Total RNAの品質指標にRIN(RNA Integrity Number)を使用しています。

RIN(RNA Integrity Number)説明.pdf

上記ファイルはAgilent Technologies社から提供された資料です。許可無く転用、複製、改変などは禁じられています。

RIN :Total RNAの分解度を数値として表示します。分解が進むと数値が低くなります。

RIN.bmp

agilent.jpg

【ご注文時の注意事項】

サンプル性状により異なります。

お問い合わせください。 

【お申込書のダウンロード】

DNA抽出サービス 申込書/PDF(200KB)

DNA抽出サービス 申込書/Excel(69.5KB)

TotalRNA(Small RNAを含む)抽出サービス 申込書/PDF(229KB)

TotalRNA(Small RNAを含む)抽出サービス 申込書/Excel(116KB)

TotalRNA抽出サービス 申込書/PDF(260KB)

TotalRNA抽出サービス 申込書/Excel(100KB)

 


【お見積もり依頼・お問い合わせ】

ジェ ネティックラボグループ 株式会社GLab病理解析センター 先端医療開発部
〒060-0009 札幌市中央区北9条西15丁目28番地196 札幌ITフロントビル3F
TEL:011-644-7333 FAX:011-644-7611
E-mail:adv-support@gene-lab.com

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