株式会社ジェネティックラボ｜受託解析サービス - Targeted Genotyping - 標的を絞ったジェノタイピング受託解析サービス

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Targeted Genotyping／標的を絞ったジェノタイピング

多くのご要望をいただいていた、Affymetrix社のGeneChip(R) TargetedGenotyping受託解析サービスが、遂に可能となりました。

【特長】

全ゲノムアソシエーションまたは連鎖解析によって候補遺伝子の特定領域を同定した後、GeneChip(R)カスタムジェノタイピングソリューションを利用して疾病または変異的薬剤反応に関連した遺伝子を標的化することが可能です。さらに、農業など、人間の身体以外のアプリケーションのためのカスタムSNPアッセイをデザインすることも可能です。

アフィメトリクスでは、GeneChip(R) Universal Tag Arrayと標的ジェノタイピング試薬を含む、候補遺伝子解析とファインマッピングのための幅広い製品とサービスを提供しています。

AFFYMETRIX(R) Authorized service provider

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【技術の説明】

ジェネティックラボでは、主に以下のキットでの受託解析サービスを提供しています。

Affymetrix GeneChip(R) Targeted Genotyping

製品名	概要
Human Panel 1 10K cSNP Kit	機能的（アミノ酸置換を起こす）　10,000SNPのジェノタイピング用パネル1。機能的変化をコードする、検証済み（ダブルヒット）の公開データベース中のSNPを持つ遺伝子のほとんど、また、主要な薬剤標的遺伝子ファミリーの多くが、このアッセイパネルで解析可能。
Human Panel 2 10K cSNP Kit	機能的　10,000SNPのジェノタイピング用パネル2。パネル1とは異なるcSNPで構成。
Human Panel 1&2 20K cSNP Kit	上記Human Panel 1と2を組み合わせたパネル。 20,000SNPのジェノタイピングが可能。
Human Immune and Inflammation 9K SNP Kit	ヒトの免疫や炎症反応に関与すると考えられている1,000遺伝子について選択されたSNPマーカーで構成。
Human MALD 3K SNP Kit	混合マッピング解析または混合連鎖不均衡マッピング（MALD）用にデザインされたパネル。混合集団での疾患関連遺伝子の特定に有効。
Mouse Mapping 5K SNP Kit	20種類の一般的なマウス系統の全ての交雑種に対し、1,500個の有用なマーカーを採用。5K SNPパネルを使ったSNPベースのマウス連鎖マッピング解析法はマーカー密度が高く、マーカー間隔も改善されているため、従来のマイクロサテライト技術に比べて効率。
Bovine Mapping 10K SNP Kit	単一アッセイでマルチプレックス処理された約1万SNPを含み、肉牛種と乳牛種を区別しないウシ連鎖解析用パネル。アンガス種、インド種、ヘレフォード種、ホルスタイン種、ジャージー種、ルモシン種の各品種におけるヘテロ接合体マーカーの平均数は3,300。
カスタムパネル	別途お問い合わせください。

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【必要なサンプル量】

サンプル量	アレイ5K以下の場合　5μg以上アレイ10K以上の場合　10μg以上
濃度	150ng/μL以上（これ以下の場合はエタノール沈殿による濃縮作業が必要です。）
純度	Ａ260/Ａ280 = 1.8～2.0 ※1%アガロース電気泳動にて、10-20kbの位置にバンドが見えることをご確認のうえ、電気泳動図も一緒にお送りください。