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受託解析サービス

マイクロアレイ受託解析/Affymetrix (新・Applied Biosystems‎) GeneChip受託解析

マイクロアレイ ~ コピー数変異(CNV) ~

2021/10/28 更新


ヒト全染色体レベルのコピー数変異解析用途としてGeneChip HD Arrayによるマイクロアレイ解析のサービスをご提案いたします。


■サービスの特長

  • ISCA、Cancer Gene、X Chromosome、OMIMなどのデータベースからデザインされた260万以上のCopy Numberプローブで構成されており幅広いご研究でご使用いただけます
  • 解析ソフトウェア(ChAS:Chromosome Analysis Suite)を用いてビジュアル化した解析画像データの取得が可能です
  • 高解像度(平均マーカー間隔880bp)な遺伝子コピー数以上を検出できます
  • メーカー提供referenceデータ(※)との比較を行うため、referenceサンプルのご提供が不要です
    ※referenceデータ(多人種または日本人のみ)は目的に合わせてご選択いただけます
  • SNPマーカーもデザインされているためLOHの検出も可能です
  • Positive Controlを同時アッセイすることでFFPE由来サンプルの解析も可能(※)です
    ※クオリティチェックの結果、DNAの分解が基準を満たす場合に限ります

CytoScan 解析画像例
CytoScan HD Array 製品情報はメーカーページをご覧ください

■このようなお客様にお勧めします

  • 遺伝性疾患のご研究に
  • 標的CNVのスクリーニングに

■サービス基本仕様

遺伝子発現 対応生物種 /
マーカー数
特徴
CytoScan HD ヒト 2,600,000以上
  • 高解像度(平均マーカー間隔880bp)な遺伝子コピー数異常検出
  • メーカー提供referenceデータとの比較を行うため、referenceサンプルの提供不要
  • referenceデータ(多人種or日本人のみ)は目的に合わせて選択可能
  • SNPマーカーもデザインされているためLOHの検出も可能
CytoScan 750K ヒト 750,000以上
  • CytoScan HDから主要プローブ抜粋したアレイ設計
  • 低価格
コピー数マーカーの総数 2,696,550
  ・非多型マーカーの数 1,953,246
  ・SNPマーカーの数 743,304
遺伝子型を同定可能なSNPマーカーの総数 749,157
ゲノムビルド hg19
常染色体マーカー 2,491,915
偽常染色体マーカー 4,624
遺伝子内マーカー 1,410,535
遺伝子間マーカー 1,286,015
マーカー間隔の平均(塩基対)
  ・遺伝子内 (以下のすべの遺伝子内) 880
    ISCA consitutional genes 384
    Cancer genes 553
    OMIM Morbid genes 659
    X chromosome OMIM Morbid genes 486
    RefSeq genes 880
  ・遺伝子間 (非遺伝子バックボーン) 1,737
  ・全体 (遺伝子および非遺伝子バックボーン) 1,148
遺伝子カバー率 (25マーカー/100kb)
ISCA constitutional genes (340) 100%
Cancer genes (526) 100%
OMIM Morbid genes (2,640) 98%
X chromosome OMIM Morbid genes (177) 100%
RefSeq Genes (36,121) 96%

■受け入れサンプル

  • dsDNA(1μg以上、50ng/μL以上)                 
  • 全血(2mL以上、PAXgene採血管など)
  • 細胞(5×106~1×107個、凍結ペレット)
  • 組織(5mm角を超えない大きさ3~5個、凍結)
  ※上記基準に満たない場合、その他サンプル性状の場合はお問い合わせください
  ※サンプル準備~ご発送手順ページもご覧ください

■基本納品物

  • 試験報告書
  • 解析データ(CD-R / DVD-R)

■報告書内容見本


↑クリックで報告書内容見本をダウンロード

■納期

  • アレイ調達:1~3週間
  • 解析:15営業日~

■オプションサービス

  • DNA抽出

■関連するアプリケーション

  • リアルタイムPCR ~ コピー数変異(CNV) ~
  • デジタルPCR ~ コピー数変異(CNV) ~
  • DNA-FISH

■申込書/注意事項のダウンロード

申込書等ダウンロードサービスページをご利用ください。

■ご注文について

ご注文方法は、事前に試験仕様等のお打ち合せをさせていただいたうえで、ご案内させていただきます。まずはお気軽にお問い合わせください。

 <お問い合わせ先>
 株式会社ジェネティックラボ 営業部 【sales▲gene-lab.com 】
 〒 060-0009
 札幌市中央区北9条西15丁目28-196 札幌ITフロントビル3F
 TEL/FAX 【 011-644-7333 / 011-644-7611 】
 ※メールをお送りいただく場合は、「▲」部分を「@」に変えてお問い合わせ下さい。

以下の情報をご提供いただけると、お見積のご案内がスムーズです。(未定の項目があっても構いません)

<ご提供いただきたい情報>

  1. ご希望のサービス名(例:マイクロアレイ ~ コピー数変異(CNV) ~)
  2. 生物種:ヒトのみの対応となります
  3. サンプル性状 (dsDNA、全血、細胞、組織など)
  4. サンプル数
  5. ご希望のアレイ種
※FFPE由来または受け入れサンプル基準に満たないサンプルの場合は併せてお問い合わせください。

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