2022.07.29 ジェネティックラボ・究めーる [vol.121]
最新のバイオマーカー解析技術と病理専門医による組織病理学的解析を。
基礎・臨床研究から治療までサポートいたします。
ジェネティックラボ 究めーる [vol.121] 2022.7.29(金)発行
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【今号のもくじ】
◆ 空間トランスクリプトーム連載第三回！
◇ 日本癌学会・日本癌治療学会出展情報
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いつも究めーるをご覧いただき誠にありがとうございます。
7月7日は七夕でしたね。「1年に一度だけ織姫と彦星が会える」という伝説はとても有名です。
この織姫と彦星は、実際はベガとアルタイルという名前で、夏の大三角形の2角を担う恒星です。夜空を見上げると、2つの星はそう遠くないように感じますが、織姫（ベガ）から彦星（アルタイル）までの距離は約15光年。つまり彦星が光の速さで織姫のもとへ駆けつけるには15年、ふたりが同時に光の速さで駆け出しても出会うまでに7年半もかかるくらいの距離なのです。もし現代のメッセージアプリで連絡をとろうとするなら、既読まで15年、返信が届くまでなんと30年！気が遠くなるくらいの遠距離恋愛です。先日のKDDIの大規模障害も記憶にあたらしいかと思いますが、いつでも連絡をとりあえるのは、当たり前のことではないのかもしれませんね。
コロナ禍の影響で人との距離感も変化してきた今日この頃。ジェネティックラボでも、実際にみなさまのもとへお伺いするのが難しい場合でもWEBでのご面談など、柔軟に対応させていただいています。もちろんお問い合わせのお返事には15年もかかりませんのでご安心を(^^）すぐに対応いたしますので、どんなことでもお気軽にお問合せくださいね。
ジェネティックラボ 受託解析サービス
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≪ 空間トランスクリプトーム連載 vol.3 ≫
さて、空間トランスクリプトームの連載も今回で3回目となりました。前回は大別して2つの解析技術をご紹介しましたが、今回から「局在型」の技術をもう少し掘り下げてご紹介したいと思います。
現在、弊社で準備中のNanoString社「GeoMx」のご案内になります。前回の繰り返しになりますが、GeoMxは関心領域（ROI）のみに限定し、RNAやタンパク質の発現を定量できるのが大きな特徴になります。免疫染色やISHでは限られたターゲットの情報しか得ることができません。一方、この技術ではヒトおよびマウスの約20,000種の遺伝子や100種以上のタンパク質を1回のアッセイで解析することが可能です。このような特徴から、免疫腫瘍学や神経科学のご研究のアーリーフェーズのマーカー探索などにお役に立てるのではと考えています。もちろん、マーカー選定後の免疫染色やISHなどの従前技術もご提案ができますので、幅広いご研究フェーズをカバーしたワンストップな研究支援をジェネティックラボはご提供可能です。
～ GeoMxの解析ステップ概略 ～
解析ステップ概略は以下になります。
１．蛍光多重染色標本の作製
抗体にはタンパク質検出用オリゴ、RNA検出用のプローブが結合されています。
２．イメージング
１．で染色した画像を共有し、回収するROIの選定を行います。
３．ROI回収
２．で選定したROIをGeoMxで自動的に回収します。1μm角のミラーが100万個整列した「デジタルマイクロミラーデバイス」を用い、ミラーの角度を変えて、ROIにUV光を照射することで抗体に結合されたプローブを回収します。回収したプローブは96ウェルプレートの各ウェルに保存されます。
４．プローブは個々のターゲットを標識する分子バーコードでラベルされており、タンパク質であればnCounter、RNAであればNGSを用いて判読します。
５．判読後のデータをGeoMxへインポート後、アプリケーションソフトで解析したデータをご報告いたします。
以上、簡単ではありますが概略のご説明でした。次回はROI回収の詳細についてご紹介したいと思います。
GeoMxシステムによる空間トランスクリプトーム解析（随時更新中）
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サービス開始までもう少しお待ちください！！
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≪ ジェネティックラボ 学会出展情報 ≫
今秋、日本癌学会、日本癌治療学会にてブース展示を予定しています。
第81回 日本癌学会
2022年9月29日～10月1日＠パシフィコ横浜
https://site.convention.co.jp/jca2022/
第60回 日本癌治療学会
2022年10月20日～10月22日＠神戸コンベンションセンター
https://congress.jsco.or.jp/jsco2022/
今秋リリース予定のGeoMxシステムによる空間トランスクリプトーム解析の資料、ノベルティなど、準備をすすめておりますので、是非当社ブースに足をお運びいただけると幸いです。
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いかがでしたか？ジェネティックラボでは各種オプションサービスもご用意しております。その他、納期や料金など、どんなことでも以下のページからお気軽にお問い合わせください！
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