2022.08.08 ジェネティックラボ・究めーる [vol.122 臨時号]
最新のバイオマーカー解析技術と病理専門医による組織病理学的解析を。
基礎・臨床研究から治療までサポートいたします。
ジェネティックラボ 究めーる [vol.122 臨時号] 2022.8.8(月)発行
https://www.gene-lab.com?mm122
いつも究めーるをご覧いただき誠にありがとうございます。
7月29日、当社のある北海道札幌市では3年ぶりに豊平川花火大会が開催され、大いににぎわいました。少しずつではありますが、行事やイベントも感染対策を行いながら、開催されるようになりましたね。ジェネティックラボでも、今秋開催される、日本癌学会、日本癌治療学会にてブース展示を予定しています。
第81回 日本癌学会
2022年9月29日～10月1日＠パシフィコ横浜
https://site.convention.co.jp/jca2022/
第60回 日本癌治療学会
2022年10月20日～10月22日＠神戸コンベンションセンター
https://congress.jsco.or.jp/jsco2022/
GeoMxシステムによる空間トランスクリプトーム解析の資料のほか、北海道らしいノベルティなどなど、準備をすすめておりますので、是非当社ブースに足をお運びいただけると幸いです！
隅田川花火大会のルーツは1700年代に江戸で伝染病が大流行した際、八代将軍・徳川吉宗が、悪疫退散祈願と犠牲者の供養のために行った「水神祭」だといわれています。
一日も早い新型コロナウイルス感染症の終息を心から願っています。
ジェネティックラボ 受託解析サービス
https://www.gene-lab.com/gas/?mm122
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≪ 空間トランスクリプトーム vol.4 ≫
～ GeoMxにおける関心領域（ROI）の 回収方法 ～
さて、空間トランスクリプトームの連載も4回目となりました。今回はGeoMxにおける関心領域（ROI）の回収方法についてご紹介いたします。GeoMxアプリケーションツールから下記の5種類の回収方法を選択することが可能です。それぞれの特徴とあわせご紹介します。
１．Geometric
丸型や四角型、五角形型のパターンで領域を選定・回収します。組織上のさまざまな領域中の発現不均一性のご研究に適しています。直径または一辺が10～650μmの範囲で選択が可能です。
２．Segmentation
フリーハンドで領域を選定・回収します。例えば、腫瘍微小環境（TME）など、生物学的コンパートメントごとの発現プロファイルのご研究に適しています。
３．Rare Cell
単一細胞ごとに選定・回収します。特定細胞集団の発現プロファイルのご研究に適しています。
※ 後述しますが、単一細胞レベルでの解析はできません。 マーカーで識別した同一細胞集団での解析となります。
４．Contour
天気図の等高線のように特定の領域から等間隔に選定・回収します。微小環境において境界の両側でどのような発現変化が生じているのかを確認するご研究に適しています。
５．Gridded
切片全体にグリッド線を引き選定・回収します。複数ターゲットの変動を特定の組織領域で詳細にマッピングするご研究に適しています。
ROIあたり250分子程度のバーコードオリゴを回収できれば解析が可能です。目安として、直径200μm/ROIまたは200細胞/ROI以上が必要な回収量となります。
ご研究の目的に応じ是非ご検討ください。次回は解析例の詳細についてご紹介したいと思います。
GeoMxシステムによる空間トランスクリプトーム解析（随時更新中）
https://www.gene-lab.com/knowledge/transcriptomics/?mm122
サービス開始までもう少しお待ちください！！
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今回の臨時号はいかがでしたか？
ジェネティックラボでは他にもさまざまなサービスを展開しています。各種オプションサービスもご用意しております。納期や料金など、どんなことでも以下のページからお気軽にお問い合わせください！
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