2022.09.15 ジェネティックラボ・究めーる [vol.124 臨時号]
最新のバイオマーカー解析技術と病理専門医による組織病理学的解析を。
基礎・臨床研究から治療までサポートいたします。
ジェネティックラボ 究めーる [vol.124 臨時号] 2022.9.15(木)発行
https://www.gene-lab.com?mm124
いつも究めーるをご覧いただき誠にありがとうございます。
突然ですが、みなさんは普段写真を撮りますか？
カメラ人口は減ったといわれていますが、スマホのカメラ機能が充実するのにともなって、プロのカメラマンではなくても、気軽に写真や動画を撮影し、SNS等で発信できるようになりましたね。
さて、ジェネティックラボで導入をすすめているGeoMxシステムの機器メーカー、ナノストリング社では、現在、空間イメージ画像コンテストが行われています。美しく印象的な空間生物学画像はナノストリング社が作成する「2023年空間生物学カレンダー」で使用され、カレンダーは世界中で配布されるそうです。
空間イメージ画像コンテスト 2022
https://nanostring.com/about-us/events/spatial-biology-image-contest-2022/
応募締切は2022年9月20日 (火)です。ご興味のある方はぜひ応募してみてくださいね。
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≪ 空間トランスクリプトーム vol.6 ≫
～ GeoMx受託解析フロー ～
空間トランスクリプトームの連載も、いよいよ6回目となりました！今回は試験受託の流れについてご紹介いたします。
１. パネルを選択（お申込み）
- RNA解析
- Whole Transcriptome Atlas（ヒト・マウス：18,000以上）
- Cancer Transcriptome Atlas（ヒトのみ：1,800以上）
- COVID-19 Immune Response Atlas （ヒトのみ：1,800以上）
- タンパク質解析
- Immune Cell Profiling Panel（ヒト・マウス）
- Neural Cell Profiling Panel（ヒト・マウス）
※タンパク質解析は上述コアパネルに対してモジュールを追加することで以上のターゲットの解析が可能です。
２．サンプルのご提供
- 未染スライド 2枚/症例以上(5μm)
または - 未染スライド 1枚/症例以上(5μm)および連続切片のHEスライド 1枚/症例をご用意ください。
（推奨スライドガラス：Newシラン4スターフロスト水緑磨20F(51462A, 武藤化学)）
※ ホルマリン固定組織（PBS置換）、FFPEブロック、凍結OCTブロックをご提供いただき、弊社で未染スライドの作製からも承ります。
３．ROI（関心領域）の選定
- HEスライドのバーチャル画像上でROIをご指定いただきます。
※ IHC染色画像やISH染色画像からの選定もご相談承ります。
- 22か所/スライド×4スライドが基本仕様となります。
※ 選定したROIをさらにマーカーの染色態度によって2分割して解析することも可能です。その場合は、11か所×2分割/スライド×4スライドが基本仕様となります。
４．GeoMx解析
- 回収のためのスライド調製および染色画像の取り込みを実施します。
- 取り込んだ画像上でROIからインデックスオリゴを遊離・回収します。
- RNAアッセイはNGS、タンパク質解析はnCounterを使用し解析データのリードアウトを行います。
- リードアウトデータをGeoMxに取り込み、ROI間の発現差解析を実施し、ご報告します。
以上がおおまかな流れとなります。お申込みからご報告までは35営業日程度を見込んでおります。
次回は、解析データ例をご紹介する予定です。
GeoMxシステムによる空間トランスクリプトーム解析（随時更新中）
https://www.gene-lab.com/knowledge/transcriptomics/?mm124
サービス開始までもう少しお待ちくださいね！！
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≪ ジェネティックラボ 学会出展情報 ≫
9月29日（木）～10月1日（土）にパシフィコ横浜にて開催される「第81回日本癌学会学術総会」の当社のブース番号が決定しました。当日はGeoMxシステムによる空間トランスクリプトーム解析をはじめ、弊社の受託解析サービスについてご相談いただけます。
第81回 日本癌学会学術総会
https://site.convention.co.jp/jca2022/
2022年9月29日（木）～10月1日（土）
パシフィコ横浜 ブース 14番
ノベルティ等準備を着々とすすめております。是非、この機会に弊社ブース（14番）にお立ち寄りください！
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いかがでしたか？ジェネティックラボでは各種オプションサービスもご用意しております。その他、納期や料金など、どんなことでも以下からお気軽にお問い合わせください！
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